लुइगी रिकियार्डी 1 , रोझा मॅझेओ 2,*©, अँजेलो राffaele Marcotrigiano 1 , गुग्लिएल्मो रेनाल्डी 3 , पाओलो इओव्हिएनो 4 , Vito Zonno 1 , स्टेफानो पवन १२© आणि कॉन्सेटा लोटी 2,*
- 1 मृदा, वनस्पती आणि अन्न विज्ञान विभाग, वनस्पती आनुवंशिकी आणि प्रजनन युनिट बारी विद्यापीठ, Amendola 165/A मार्गे, 70125 बारी, इटली; luigi.ricciardi@uniba.it (एलआर);angelo.marcotrigiano@uniba.it (एआरएम); vito.zonno@uniba.it (व्हीझेड); stefano.pavan@uniba.it (SP)
- 2 कृषी, अन्न आणि पर्यावरण विज्ञान विभाग, फोगिया विद्यापीठ, नेपोली 25, 71122 फोगिया, इटली
- 3 बायोसायन्स, बायोटेक्नॉलॉजी आणि बायोफार्मास्युटिकल्स विभाग, बारी विद्यापीठ, वाया ओराबोना 4, 70125 बारी, इटली; guglielmo.rainaldi@uniba.it
- 4 ऊर्जा तंत्रज्ञान विभाग, बायोएनर्जी, बायोरिफायनरी आणि ग्रीन केमिस्ट्री विभाग, ENEA ट्रिसिया संशोधन केंद्र, SS 106 Ionica, km 419+500, 75026 Rotondella (MT), इटली; paolo.iovieno@enea.it
* पत्रव्यवहार rosa.mazzeo@unifg.it (आरएम); concetta.lotti@unifg.it (CL)
गोषवारा:
कांदा (ॲलियम सेपा L.) हे जगभरातील दुसरे सर्वात महत्वाचे भाजीपाला पीक आहे आणि त्याच्या आरोग्य फायद्यांसाठी त्याचे सर्वत्र कौतुक केले जाते. त्याचे महत्त्वपूर्ण आर्थिक महत्त्व आणि कार्यात्मक अन्न म्हणून त्याचे मूल्य असूनही, कांद्याचे अनुवांशिक विविधतेच्या संदर्भात खराब तपासणी केली गेली आहे. येथे, आम्ही बारी प्रांतातील (अपुलिया, दक्षिणेकडील इटली) येथील एका लहानशा शहरात लागवडीचा शतकानुशतक जुना इतिहास असलेल्या “अक्वाविवा लाल कांदा” (एआरओ) मधील अनुवांशिक फरकाचे सर्वेक्षण केले. 11 एआरओ लोकसंख्या आणि तीन सामान्य व्यावसायिक प्रकार असलेल्या जर्मप्लाझम संग्रहातील अनुवांशिक भिन्नता शोधण्यासाठी 13 सूक्ष्म उपग्रह मार्करचा संच वापरण्यात आला. पॅरामेट्रिक आणि नॉन-पॅरामेट्रिक पद्धतींसह अनुवांशिक संरचनेचे विश्लेषण ठळकपणे दर्शविते की एआरओ एक सुस्पष्ट जीन पूलचे प्रतिनिधित्व करते, जे ट्रोपिया आणि मॉन्टोरो लँडरेसेसपासून स्पष्टपणे वेगळे आहे ज्यासह ते सहसा चुकीचे असते. सामान्यतः ताज्या वापरासाठी वापरल्या जाणाऱ्या बल्बचे वर्णन देण्यासाठी, विद्राव्य घन सामग्री आणि तिखटपणाचे मूल्यमापन केले गेले, जे वर नमूद केलेल्या दोन लँडरेसच्या संदर्भात ARO मध्ये उच्च गोडपणा दर्शविते. एकूणच, सध्याचा अभ्यास एआरओच्या भविष्यातील व्हॅलॉरायझेशनसाठी उपयुक्त आहे, ज्याची गुणवत्ता लेबलांद्वारे जाहिरात केली जाऊ शकते ज्यामुळे व्यावसायिक फसवणूक मर्यादित करण्यात आणि लहान धारकांच्या उत्पन्नात सुधारणा होऊ शकते.
परिचय
Allium वंशामध्ये सुमारे 750 प्रजातींचा समावेश आहे [1], त्यापैकी कांदा (Allium cepa L., 2n = 2x =16) सर्वात व्यापक आहे. A. cepa मध्ये द्विवार्षिक चक्र असते आणि प्रजनन वर्तन बाहेर येते. आजकाल, कांद्याचे जागतिक उत्पादन (97.9 Mt) टोमॅटो [२] नंतरचे दुसरे महत्त्वाचे भाजीपाला पीक बनवते. जुन्या काळापासून, कांद्याचे बल्ब अन्न म्हणून आणि लोक औषधी उपयोगात वापरले गेले आहेत. खरंच, प्राचीन इजिप्शियन लोकांनी 2 बीसी, कोडेक्स एबर्स [३] च्या वैद्यकीय पॅपिरसमध्ये लसूण आणि कांद्याच्या वापरावर आधारित अनेक उपचारात्मक सूत्रे आधीच नोंदवली आहेत.
ही बहुमुखी आणि आरोग्यदायी भाजी कच्ची, ताजी किंवा प्रक्रिया केलेले पदार्थ म्हणून वापरली जाते आणि अनेक पदार्थांची चव वाढवण्यासाठी वापरली जाते. अलीकडील अनेक अभ्यासांचा दावा आहे की कांद्याचे सेवन हृदय व रक्तवाहिन्यासंबंधी रोग [४,५], लठ्ठपणा [६], मधुमेह [७] आणि कर्करोगाचे विविध प्रकार [८-१०] कमी करू शकते. कांद्याच्या आरोग्यविषयक गुणधर्मांचे श्रेय बहुतेकदा दोन वर्गांच्या न्यूट्रास्युटिकल संयुगेच्या उच्च पातळीला दिले जाते: फ्लेव्होनॉइड्स आणि अल्क(en)yl सिस्टीन सल्फॉक्साइड्स (ACSOs). पहिल्या वर्गात फ्लेव्होनॉल्स आणि अँथोसायनिन्स समाविष्ट आहेत. क्वेर्सेटिन हे मुख्य शोधण्यायोग्य फ्लेव्होनॉल आहे, जे फ्री रॅडिकल स्कॅव्हेंजिंग आणि ट्रांझिशन मेटल आयन बंधनात मजबूत अँटिऑक्सिडंट आणि दाहक-विरोधी गुणधर्मांसाठी ओळखले जाते. [11]; तर अँथोसायनिन्स कांद्याच्या काही जातींना लाल/जांभळा रंग देतात. ACSO साठी, सर्वात मुबलक isoalliin [(+)-trans-S-1-propenyl-L-cysteine sulfoxide] [12], एक नॉन-अस्थिर आणि नॉन-प्रोटीनोजेनिक सल्फर अमीनो ऍसिड पेशींमध्ये साठवले जाते, जे कांद्याच्या तीव्र सुगंध आणि चवसाठी अप्रत्यक्षपणे जबाबदार असते. [13]. ऊतींमध्ये व्यत्यय आल्यावर, आयसोअलिन हे अस्थिर संयुगे (पायरुवेट, अमोनिया, थायोसल्फोनेट आणि प्रोपेनेथियल एस-ऑक्साइड) तयार करण्यासाठी एन्झाइम ॲलिनेझद्वारे क्लीव्ह केले जाते ज्यामुळे फाटणे आणि अप्रिय वास येतो (तीव्रपणा) [14]. कांद्याची तिखटपणा बहुतेक वेळा हायड्रोलिसिसद्वारे तयार झालेल्या पायरुव्हिक ऍसिडच्या ताज्या वजनाच्या प्रति ग्रॅमच्या प्रमाणात मोजली जाते. [15,16].
भूमध्यसागरीय खोऱ्यातील देशांमध्ये, दुय्यम विविधता केंद्रांपैकी एक म्हणून प्रस्तावित A. cepa [17,18], कांद्याचे बल्ब आकार, आकार, रंग, कोरडे पदार्थ आणि तिखटपणा यांमध्ये विस्तृत परिवर्तनशीलता प्रदर्शित करतात [19-२२]. शिवाय, सल्फर-आधारित फलन, कृषी पद्धती, मातीचा प्रकार, हवामानाची परिस्थिती आणि वाण किंवा लँडरेसचे जीनोटाइप विशिष्ट ऑर्गनोलेप्टिक आणि पौष्टिक मूल्ये प्रदान करून बल्बच्या गुणवत्तेवर प्रभाव टाकू शकतात. [23-२२]. इटलीमध्ये, कांद्याच्या जर्मप्लाझमची विस्तृत उपलब्धता असूनही, कांद्याच्या फक्त काही जातींवरच शास्त्रीय अभ्यास केला जातो आणि योग्यरित्या वैशिष्ट्यीकृत केले जाते. [28,29].
वनस्पती अनुवांशिक संसाधनांचे योग्य संरक्षण सुनिश्चित करण्यासाठी आणि मूल्य शृंखलामध्ये विशिष्ट जीनोटाइपच्या वापरास प्रोत्साहन देण्यासाठी कृषी-जैवविविधतेचे पूर्णपणे अनुवांशिक आणि फिनोटाइपिक वैशिष्ट्य महत्त्वपूर्ण आहे. [30-२२]. मॅपिंगसाठी सिंपल सिक्वेन्स रिपीट (एसएसआर) मार्कर अनेकदा निवडले गेले आहेत [33-२२], डीएनए फिंगरप्रिंटिंग आणि कल्टिव्हर भेदभाव [36-२२], आणि लँडरेसमध्ये आणि त्यांच्यामध्ये अनुवांशिक परिवर्तनशीलतेचा विश्वासार्ह अंदाज [39-२२], कारण ते लोकस स्पेसिफिक, मल्टी-ॲलेलिक, कॉडोमिनंटली वारशाने मिळालेले, उच्च पुनरुत्पादक आणि स्वयंचलित जीनोटाइपिंगसाठी योग्य आहेत.
सध्याच्या अभ्यासात, आम्ही आमचे लक्ष एका अपुलियन पारंपारिक लँडरेसवर केंद्रित केले, “अक्वाविवा लाल कांदा” (एआरओ), ज्याची लागवड बारी प्रांतातील अक्वाविवा डेले फॉन्टी शहराच्या एका छोट्या भागात सेंद्रिय शेती पद्धतीनुसार केली जाते. (अपुलिया, दक्षिण इटली). या लँडरेसचे बल्ब मोठे आणि सपाट आणि लाल रंगाचे आहेत आणि स्थानिक पाककृतींमध्ये मोठ्या प्रमाणावर वापरले जातात. ARO ला "स्लो फूड प्रेसीडियम" गुणवत्ता चिन्ह मिळाले असले तरी, त्याचे उत्पादन संरक्षित भौगोलिक संकेत (PGI) आणि संरक्षित पदनाम (POD) यांसारख्या युरोपियन युनियन गुणवत्तेद्वारे अधिक प्रोत्साहन आणि संरक्षित केले जाऊ शकते, कारण ते मर्यादित करण्यासाठी योगदान देऊ शकतात. व्यावसायिक फसवणूक आणि लहानधारकांचे उत्पन्न सुधारणे. येथे, ARO लोकसंख्येतील अनुवांशिक भिन्नतेचे मूल्यांकन करण्यासाठी आणि इतर दोन दक्षिणी इटालियन लाल कांदा लँडरेसपासून या लँडरेसचा भेदभाव करण्यासाठी SSR आण्विक चिन्हकांचा वापर शक्तिशाली साधने म्हणून केला गेला. शिवाय, बाजारातील मागणीच्या संदर्भात ARO चवचे मूल्यांकन करण्यासाठी आम्ही तिखटपणा आणि विरघळणारी घन सामग्रीचा अंदाज लावला.
परिणाम
एक्वाविवा लाल कांदा जर्मप्लाझम संकलन आणि मॉर्फोलॉजिकल वैशिष्ट्यांची स्थापना
बायोडायव्हर्सओ अपुलिया क्षेत्र प्रकल्पाच्या चौकटीत शेतकऱ्यांनी दान केलेल्या ARO लँडरेसच्या 13 लोकसंख्येच्या बिया ARO जर्मप्लाझम संग्रह स्थापन करण्यासाठी वापरण्यात आल्या.
एआरओ जर्मप्लाझम आणि तीन कांद्याच्या लँडरेसवर बल्ब, त्वचा आणि मांसाशी संबंधित मॉर्फोलॉजिकल डिस्क्रिप्टर्स गोळा केले गेले, दोन “ट्रोपीया रेड ओनियन” (टीआरओ) लँडरेसचे आणि एक “मॉन्टोरो कॉपर ओनियन” (एमसीओ) लँडरेस (आकृती). 1). सर्व एआरओ बल्ब सपाट होते आणि लाल रंगाच्या वेगवेगळ्या छटा असलेल्या बाह्य त्वचेचे आणि मांसाचे वैशिष्ट्य होते. याउलट, TRO बल्बचे मांस पूर्णपणे लाल होते, तर MCO बल्बचे मांस खराब रंगद्रव्य होते (टेबल S1). जैवरासायनिक विश्लेषणास घन विद्रव्य सामग्री आणि तिखटपणाचे मूल्यांकन करण्याची परवानगी आहे. टेबलमध्ये नोंदवल्याप्रमाणे 1, एआरओ लोकसंख्येमध्ये बल्बच्या घन विद्रव्य सामग्रीचे सरासरी मूल्य 7.60 होते आणि ते 6.00 (ARO12) ते 9.50° ब्रिक्स (ARO11 आणि ARO13) होते. हे मूल्य TRO आणि MCO लँडरेसेस (अनुक्रमे 4.25 आणि 6.00° ब्रिक्स) साठी अंदाजित मूल्यापेक्षा जास्त होते.
टेबल 1 सॉलिड विरघळणारी सामग्री आणि तिखटपणा मूल्ये “Acquaviva Red Onion” (ARO), “Tropea Red Onion” (TRO), आणि “Montoro Copper Onion” (MCO) लोकसंख्येमध्ये मूल्यांकन केले गेले*.
CODE | विरघळणारी घन सामग्री (ब्रिक्स) | तिखटपणा (pमोलग-1 FW) | ||
मध्य | CV y (%) | मध्य | CV y (%) | |
ARO1 | ६.२५ डी* | 5.65 | ५.८४ ab* | 23.78 |
ARO2 | एक्सएनयूएमएक्स डीसी | 4.87 | 6.51 a | 22.98 |
ARO3 | 7.50 BCD | 9.42 | 5.28 अब | 22.88 |
ARO4 | 7.50 BCD | 0.00 | 6.97 a | 3.74 |
ARO 5 | 7.50 BCD | 0.00 | 6.80 a | 9.68 |
ARO6 | 6.25 D | 5.65 | 4.51 अब | 39.18 |
ARO7 | एक्सएनयूएमएक्स डीसी | 4.87 | 5.25 अब | 15.44 |
ARO8 | 9.00 अ | 0.00 | 7.04 a | 3.49 |
ARO9 | 8.25 ABC | 4.28 | 6.84 a | 0.15 |
ARO10 | एक्सएनयूएमएक्स डीसी | 0.00 | 5.94 अब | 6.57 |
ARO11 | 9.50 एक | 7.44 | 5.54 अब | 16.43 |
ARO12 | 6.00 D | 0.00 | 4.91 अब | 9.70 |
ARO13 | 9.50 एक | 7.44 | 6.63 a | 24.93 |
MCO | 6.00 D | 0.00 | 4.18 अब | 2.66 |
TRO1 | 4.25 ई | 8.31 | 2.80 बी | 2.10 |
TRO2 | 4.25 ई | 8.31 | 4.28 अब | 4.79 |
* अप्परकेस किंवा लोअरकेसमध्ये समान अक्षरे असलेले अर्थ अनुक्रमे 0.01P किंवा 0.05P वर सांख्यिकीयदृष्ट्या भिन्न नाहीत (SNK ची चाचणी). y भिन्नतेचे गुणांक.
पायरुविक ऍसिड सामग्रीद्वारे मूल्यांकन केलेले एआरओ तिखटपणाचे सरासरी मूल्य 6.00 होते, ते 4.51 पीएमओएल ग्रॅम पर्यंत होते-1 FW (ARO6) ते 7.04 (ARO8). हे मूल्य TRO आणि MCO लँडरेसेस (3.54 pmol g-1 FW आणि 4.18 pmol g-1 FW, अनुक्रमे).
एसएसआर पॉलिमॉर्फिझम आणि ऍक्सेसन्समधील अनुवांशिक संबंध
सध्याच्या अभ्यासात, चाचणी केलेल्या 11 पैकी 37 SSR प्राइमर संयोजनांनी सिंगल-लोकस पॉलीमॉर्फिज्म प्रदान केले, म्हणजे, एकाच व्यक्तीमध्ये जास्तीत जास्त दोन प्रवर्धक उत्पादने मिळतात. एकंदरीत, 55 (ACM320 आणि ACM 2) ते 147 (ACM504) आणि 11 alleles (सारणी) ची सरासरी किंमत 132 व्यक्तींमध्ये 5 alleles आढळून आली. 2). वैयक्तिक लोकसंख्येमध्ये, ॲलेल्स (Na) ची संख्या 1.94 (ACM147 आणि ACM504) ते 5.38 (ACM132) पर्यंत आहे, तर alleles (Ne) ची प्रभावी संख्या 1.41 (ACM152) ते 2.82 (ACM449) पर्यंत आहे. विसंगती Na आणि Ne मधील मूल्ये लोकसंख्येमध्ये कमी वारंवारता असलेल्या ऍलील्सच्या उपस्थितीमुळे आणि फक्त काही ऍलील्सच्या प्राबल्यमुळे होती. ACM138 आणि ACM449 (0.62) साठी सर्वाधिक निरीक्षण केलेले हेटरोजायगोसिटी (Ho) मूल्य हायलाइट केले गेले, तर सर्वात कमी मूल्य ACM152 (0.25) शी संबंधित होते. अपेक्षित हेटरोजिगोसिटी (He), जे पॅनमिक लोकसंख्येतील सैद्धांतिक अपेक्षेशी संबंधित आहे, 0.37 (ACM504) ते 0.61 (ACM132, ACM138, आणि ACM449) पर्यंत आहे. राइट्स फिक्सेशन इंडेक्स (Fis), सर्व मार्करसाठी शून्य (सरासरी 0.05) च्या जवळ प्रदर्शित मूल्ये, निरीक्षण केलेल्या आणि अपेक्षित विषमता स्तरांमधील समान मूल्ये दर्शवितात, ज्या आउटक्रॉसिंग प्रजातींसाठी अपेक्षेनुसार आहेत. अनुवांशिक फिंगरप्रिंटिंगमध्ये वैयक्तिक SSR मार्करच्या कार्यक्षमतेचा अंदाज बहुरूपी माहिती सामग्री (PIC) निर्देशांकाद्वारे 0.48 च्या सरासरी मूल्यासह आणि 0.33 (ACM504) ते 0.67 (ACM132) पर्यंत होता. आणखी एक कार्यक्षमता निर्देशांक, शॅननच्या माहिती निर्देशांक (I) ने सरासरी मूल्य 0.84 प्रदर्शित केले आणि गृहीत मूल्ये 0.45 (ACM152) ते 1.20 (ACM132) पर्यंत आहेत.
टेबल 2 एआरओ, टीआरओ आणि एमसीओ लोकसंख्येमध्ये अनुवांशिक विविधतेचा अंदाज लावण्यासाठी वापरल्या जाणाऱ्या 11 एसएसआर मार्करची पॉलिमॉर्फिझम वैशिष्ट्ये. या अभ्यासात एकूण 320 जीनोटाइप केलेल्या व्यक्तींच्या एकूण संचाचा संदर्भ घ्या. ॲलेल्सची संख्या (Na), प्रभावी ॲलिल्सची संख्या (Ne), निरीक्षण केलेली हेटरोजायगोसिटी (हो), अपेक्षित हेटरोजायगोसिटी (हे), फिक्सेशन इंडेक्स (एफ).is), आणि शॅननचा माहिती निर्देशांक (I) 16 लोकसंख्येमधून गणना केलेल्या सरासरी मूल्यांचा संदर्भ देते, प्रत्येक 20 व्यक्तींनी बनवलेला असतो.
लोकस. | एकूण ना | आकार श्रेणी (bp) | PIC | मध्य | |||||
Na | Ne | Ho | He | I | Fis | ||||
ACM91 | 4 | 189-205 | 0.40 | 2.63 | 1.72 | 0.38 | 0.39 | 0.66 | 0.04 |
ACM101 | 4 | 229-241 | 0.52 | 2.94 | 2.37 | 0.53 | 0.56 | 0.92 | 0.06 |
ACM132 | 11 | 186-248 | 0.67 | 5.38 | 2.78 | 0.55 | 0.61 | 1.20 | 0.09 |
ACM138 | 5 | 242-272 | 0.66 | 3.69 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.09 | -0.02 |
ACM147 | 2 | 264-266 | 0.37 | 1.94 | 1.83 | 0.44 | 0.44 | 0.62 | -0.01 |
ACM152 | 4 | 228-244 | 0.25 | 2.38 | 1.41 | 0.25 | 0.27 | 0.45 | 0.07 |
ACM235 | 4 | 286-298 | 0.41 | 2.81 | 1.77 | 0.44 | 0.41 | 0.72 | -0.06 |
ACM446 | 6 | 108-120 | 0.56 | 3.50 | 2.48 | 0.49 | 0.58 | 1.01 | 0.16 |
ACM449 | 8 | 120-140 | 0.66 | 4.88 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.18 | -0.03 |
ACM463 | 5 | 202-210 | 0.47 | 3.38 | 1.95 | 0.46 | 0.48 | 0.83 | 0.05 |
ACM504 | 2 | 188-192 | 0.33 | 1.94 | 1.64 | 0.30 | 0.37 | 0.54 | 0.20 |
मध्य | 5 | 0.48 | 3.22 | 2.15 | 0.46 | 0.48 | 0.84 | 0.05 |
लोकसंख्येमध्ये, ARO3, ARO6, ARO8, ARO10, TRO1, आणि MCO यांनी उच्च पातळीचे अनुवांशिक भिन्नता (Ho > 0.5) प्रदर्शित केली, तर ARO7 (हो = 0.27) (पूरक तक्ता S2) लोकसंख्येमध्ये सर्वात कमी विविधता दिसून आली. एकंदरीत, सर्व ऍक्सेसन्स F प्रदर्शित झालेis शून्याच्या जवळ असलेली मूल्ये (Fis सरासरी मूल्य = 0.054), यादृच्छिक मिलन परिस्थितीत अपेक्षेप्रमाणे.
आण्विक भिन्नता आणि अनुवांशिक संरचनेचे विश्लेषण
AMOVA द्वारे लोकसंख्येमध्ये आणि लोकसंख्येमध्ये अनुवांशिक भिन्नतेचे श्रेणीबद्ध विभाजन केले गेले. परिणामांनी लोकसंख्येमध्ये (87%) अनुवांशिक भिन्नतेचा लक्षणीय अंश हायलाइट केला. लोकसंख्येमधील फरक, 13%, अत्यंत लक्षणीय होता (P < ०.००१) (सारणी 3). 0.002 (ARO2/ARO10) ते 0.468 (ARO7/TRO2) या राइटच्या Fst फिक्सेशन इंडेक्सचे एकसमान, Fpt पॅरामीटरची जोडीनुसार मूल्ये लक्षणीय होती (P < ०.०५), नऊ जोडीनुसार तुलना वगळता (पूरक तक्ता S0.05).
टेबल 3 च्या 320 लोकसंख्येतील 16 जीनोटाइपच्या आण्विक भिन्नतेचे विश्लेषण Iumलियम केपा L.
स्रोत | df | वर्गांची बेरीज | भिन्नता अंदाज | भिन्नता (%) | Fpt | P |
लोकसंख्येमध्ये | 15 | 458.63 | 1.16 | 13% | ||
लोकसंख्येच्या आत | 304 | 2272.99 | 7.50 | 87% | 0.134 | 0.001 |
एकूण | 319 | 2731.62 | 8.66 |
मध्ये अनुवांशिक संरचनेची तपासणी A. cepa या अभ्यासात जीनोटाइप केलेले संकलन सॉफ्टवेअर स्ट्रक्चरमध्ये लागू केलेल्या मिश्रण मॉडेल-आधारित क्लस्टरिंग विश्लेषणाद्वारे केले गेले. Evanno AK पद्धतीने आमच्यासाठी सर्वात माहितीपूर्ण म्हणून दोन क्लस्टर्स (K = 2) मध्ये उपविभाग सुचवला. डेटासेट,व्या सहe पुढील सर्वोच्च peak येथे के = 5 (पूरक Rgure S1). एक के साठी = 2, ahpopulations wआधी गाढवigned ते ओnआणिf दोन क्लस्टर्स सह एक rnernbertoip गुणांक (q) > 0.7. म्हणून एसhoमध्ये wn आकृती 2a, पहिल्या क्लस्टरमध्ये (S1 नावाने) MCO आणि सर्व ARO लोकसंख्या समाविष्ट आहे, तर S2 क्लस्टरमध्ये दोन TRO लोकसंख्या समाविष्ट आहे. K = 5 वर, डेटासेटचे सखोल वर्णन प्रदान करत आहे (आकृती 2b), 75% प्रवेश पाच क्लस्टरपैकी एकास नियुक्त केले गेले. ARO (S1) आणि TRO (S2) मधील विभक्ततेची पुष्टी झाली, जरी काही ARO लोकसंख्या मिश्रित (q < 0.7) किंवा दोन नवीन क्लस्टर्स S3 आणि S4 (ARO7 आणि ARO12, अनुक्रमे) मध्ये स्वतंत्रपणे गटबद्ध केली गेली. विशेष म्हणजे, MCO व्यावसायिक प्रकाराने Apulian लाल कांद्यापासून वेगळे केलेले एक वेगळे क्लस्टर (S5) तयार केले.
लोकसंख्येमधील अनुवांशिक संबंध
एसएसआर पॉलिमॉर्फिझमला अनुवांशिक विविधतेचा डेंड्रोग्राम काढण्याची परवानगी आहे आणि फिलोजेनेटिक विश्लेषणाचे परिणाम आकृतीमध्ये दर्शविले आहेत. 3a. येथे, जर्मप्लाझम संकलन पाच गटांमध्ये विभाजित केले गेले आहे ज्याला बूटस्ट्रॅप मूल्यांद्वारे जोरदार समर्थन दिले आहे. ARO7 आणि ARO12 लोकसंख्या उरलेल्या लोकसंख्येपासून ताबडतोब विभक्त करण्यात आली आणि दोन वेगळे क्लस्टर तयार केले. तिसऱ्या क्लस्टरमध्ये TRO च्या दोन व्यावसायिक लोकसंख्येचा समावेश होता, दरम्यान चौथ्या नोडने MCO ला अकरा ARO लोकसंख्येमधून विभाजित केले. प्रिन्सिपल कोऑर्डिनेट ॲनालिसिस (पीसीओए) (आकृती) द्वारे लोकसंख्येतील अनुवांशिक संबंधांची अधिक तपासणी करण्यात आली. 3b). आधी ठळक केल्याप्रमाणे, ARO लोकसंख्या ARO12 आणि ARO7 वगळता घट्ट गटबद्ध केली गेली होती, जी PcoA प्लॉटमध्ये वेगळ्या स्थितीत दिसून आली. दोन TROs आणि MCO लोकसंख्या प्लॉटच्या खालच्या उजव्या पॅनेलमध्ये विखुरलेली होती.
आकृती 3. 16 मध्ये अनुवांशिक विविधता A. cepa त्यांच्या SSR प्रोफाइलवर आधारित, या अभ्यासात वैशिष्ट्यीकृत लोकसंख्या. (a) अनुवांशिक अंतराचा UPGMA डेंड्रोग्राम. बूटस्ट्रॅप समर्थन मूल्ये >50 संबंधित नोड्सच्या वर दर्शविली आहेत; (b) मुख्य घटक विश्लेषण (पीसीओए). फायलोजेनेटिक विश्लेषणाद्वारे व्युत्पन्न केलेल्या आणि 11 एआरओ ऍक्सेसन्सद्वारे तयार केलेल्या गटाशी पूर्णपणे जुळणारे लाल रंगात फिरलेले क्लस्टर.
चर्चा
दक्षिण इटलीमध्ये पारंपारिकपणे लागवड केलेल्या कृषी-जैवविविधतेच्या मोठ्या प्रमाणात, कांद्याचे लँडरेस विशिष्ट उत्पादनांचे प्रतिनिधित्व करतात ज्यांना अनुवांशिक धूप होण्याच्या जोखमीपासून आणि आधुनिक जातींच्या बदलाच्या धोक्यापासून संरक्षित करणे आवश्यक आहे. प्रादेशिक प्रकल्प BiodiversO च्या चौकटीत, स्थानिक वारसाशी मजबूतपणे जोडलेल्या अपुलिया प्रदेशातील अनुवांशिक संसाधने गोळा करणे, वैशिष्ट्यीकृत करणे, प्रचार करणे आणि त्यांचे संरक्षण करणे या उद्देशाने, आम्ही ARO लँडरेसच्या 13 लोकसंख्येचा बीजसंग्रह स्थापित केला. आम्ही डीएनए पॉलीमॉर्फिजम आणि दोन बायोकेमिकल पॅरामीटर्स, विरघळणारे घन आणि पायरुव्हिक ऍसिड सामग्री, स्वाद वैशिष्ट्यांशी संबंधित आणि ताज्या न शिजवलेल्या उत्पादनांच्या स्वीकृतीसाठी महत्त्व असलेल्या ARO भिन्नतेचे पहिले मूल्यांकन नोंदवले. याव्यतिरिक्त, एआरओ लँडरेसवरील डेटाची तुलना इतर दोन रंगद्रव्ययुक्त कांद्याच्या लँडरेसवर गोळा केलेल्या डेटाशी केली गेली ज्यामध्ये ते सहसा चुकीचे होते.
गोड कांदा उद्योग मार्गदर्शक तत्त्वांनुसार, बायोकेमिकल विश्लेषणाने उच्च विद्रव्य घन सामग्री आणि मध्यम तिखटपणा यांच्याशी संबंधित 13 एआरओ लोकसंख्येचा गोडपणा हायलाइट केला. [31]. ARO बल्ब TRO आणि MCO लँडरेसेसपेक्षा गोड होते आणि ते थोडे जास्त तिखटपणा दाखवत होते. तथापि, कांद्यामध्ये गोडपणा साखरेचे प्रमाण आणि तिखटपणा यांच्यातील समतोलपणामुळे आहे, म्हणून हे वैशिष्ट्य मूल्याच्या जीनोटाइपच्या निवडीस समर्थन देण्यासाठी उपयुक्त ठरू शकते, सामान्यतः शेतकरी केवळ आकृतिविज्ञानाच्या आधारावर करतात.
एसएसआर मार्कर जीनोटाइपमध्ये भेदभाव करण्यासाठी एक उपयुक्त साधन असल्याची पुष्टी केली गेली, जरी एक्वाविवा डेले फॉन्टी शहरासारख्या अरुंद वाढत्या परिसरात गोळा केले गेले. निवडलेल्या मार्करने पूर्वी नोंदवलेल्या मार्करपेक्षा जास्त प्रमाणात ॲलेल्स दाखवले [43] आणि [44], परंतु द्वारे नोंदवलेल्या मार्करपेक्षा कमी [45]. शिवाय, आमच्या मार्करच्या 50% संचाने PIC निर्देशांक मूल्ये 0.5 पेक्षा जास्त दर्शविली, जे संग्रहातील लोकसंख्येमध्ये भेदभाव करण्यासाठी योग्य असल्याचे सिद्ध झाले, जसे की [46]. लोकसंख्येतील विविधतेचे मूल्यांकन Ho आणि He मधील समान मूल्ये प्रकट करते, परिणामी Fi कमी होतेs मूल्ये च्या आउट-क्रॉसिंग निसर्गाशी हे सहमत आहे A. cepa, जे गंभीरपणे इनब्रीडिंग डिप्रेशनने ग्रस्त आहे [47]. एकूणच Fis या अभ्यासात विचारात घेतलेल्या कांद्याच्या लोकसंख्येमध्ये मोजलेले मूल्य (0.054) पूर्वी नोंदवलेल्या मूल्यापेक्षा कमी होते [45] (0.22) आणि द्वारे आढळलेल्या एकाशी जवळजवळ समान [31] (0.08) आणि [48] (0.00) ज्यांनी अनुक्रमे वायव्य स्पेन आणि नायजरमधील कांदा लँडरेसमध्ये अनुवांशिक विविधतेचे मूल्यांकन केले. एआरओ लोकसंख्येमधील विषमतेचे लक्षणीय स्तर या कल्पनेला बळकटी देतात की अपुलिया अनेक बागायती प्रजातींसाठी विविधता केंद्र दर्शवते. [32, 42, 49-२२].
AMOVA ने हायलाइट केले की या अभ्यासात जीनोटाइप केलेल्या संग्रहातील बहुतेक आण्विक भिन्नता लोकसंख्येमध्ये आहे. तथापि, लोकसंख्येमध्ये लक्षणीय अनुवांशिक फरक (एफPT मूल्ये) अनुवांशिक स्तरीकरणाची घटना प्रकट करते. खरं तर, जरी आमच्या परिणामांनी बहुतेक ARO लोकसंख्येमध्ये अनुवांशिक एकसमानतेची उपस्थिती दर्शविली, एक सुस्पष्ट क्लस्टर तयार केला, ARO7 आणि ARO12 लोकसंख्येने स्पष्टपणे वेगळे अनुवांशिक प्रोफाइल प्रदर्शित केले. हा परिणाम दोन शेतकऱ्यांनी वापरलेल्या बियांच्या भिन्न उत्पत्तीमुळे असू शकतो ज्यांच्याकडून लोकसंख्या गोळा केली गेली. शिवाय, मिळालेल्या परिणामांवर आधारित, ARO लँडरेस अनुवांशिक स्तरावर TRO आणि MCO लँडरेसेसपेक्षा स्पष्टपणे वेगळे मानले जाऊ शकते. नुकत्याच झालेल्या एका अभ्यासात, [29] "Acquaviva," "Tropea," आणि "Montoro" यासह अनेक इटालियन कांदा लँडरेसच्या अनुवांशिक विविधतेचे मूल्यांकन केले. कांद्याच्या विस्तृत संग्रहाच्या अनुवांशिक विविधतेचे मूल्यांकन करण्यासाठी लेखकांनी SNP मार्कर वापरले असले तरी, जीनोटाइपिंग "Tropea" आणि "Montoro" कांद्यापासून "Acquaviva" मध्ये भेदभाव करू शकले नाही. कदाचित, ही विसंगती आढळलेल्या कमी सरासरी PIC मूल्यामुळे आहे (0.292), ज्याने दावा केल्यानुसार विश्लेषणा अंतर्गत स्थानाची सामान्य माहितीपूर्णता सूचित करते [29]. शिवाय, त्यांच्या इटालियन क्लस्टरमध्ये उप-संरचनेच्या उपस्थितीची तपासणी करण्यासाठी, उर्वरित संग्रहापेक्षा इटालियन जीनोटाइपचे स्वतंत्रपणे विश्लेषण करणे चांगले होईल. कदाचित यामुळे भौगोलिक स्तरीकरणाशी संबंधित अनुवांशिक विविधतेच्या पॅटर्नची कल्पना करता आली असती किंवा प्रायोगिक निवडीखालील वैशिष्ट्ये.
शेवटी, सध्याचा अभ्यास स्थानिक सांस्कृतिक वारशाशी संबंधित आणि शेतकऱ्यांसाठी आर्थिक महत्त्व असलेल्या कांद्याच्या भूभागावरील सर्वसमावेशक अहवालाचे प्रतिनिधित्व करतो. आमचे परिणाम ठळकपणे दर्शवतात की, काही अपवादांसह, ARO हे एक सु-परिभाषित जनुक पूल द्वारे वैशिष्ट्यीकृत आहे, जे अनुवांशिक क्षरणाच्या जोखमीपासून संरक्षित केले जाण्यास पात्र आहे. म्हणून, अनुवांशिक विविधतेच्या या मौल्यवान स्त्रोताच्या प्रातिनिधिक संग्रहाची स्थापना करणे महत्त्वपूर्ण ठरले आहे. शेवटी, ARO चे अनुवांशिक आणि फेनोटाइपिक वैशिष्ट्य युरोपियन युनियनकडून गुणवत्ता गुण मिळविण्यासाठी उपयुक्त असू शकते.
सामुग्री आणि पद्धती
जर्मप्लाझम कलेक्शन, प्लांट मटेरियल आणि डीएनए एक्सट्रॅक्शन
ARO लँडरेसच्या 13 लोकसंख्येचा संच अपुलिया प्रदेश प्रकल्पाच्या चौकटीत अधिग्रहित करण्यात आला (बायोडायव्हर्सओ: https://www.biodiversitapuglia.it/), इटलीच्या बारी प्रांतातील "एक्वाविवा डेले फॉन्टी" या लहान अपुलियन शहरामध्ये चालवलेल्या मोहिमांच्या मालिकेद्वारे. भौगोलिक माहिती प्रणाली (GIS) द्वारे प्रत्येक प्रवेशाच्या संकलन साइट्स मॅप केल्या गेल्या आणि टेबलमध्ये अहवाल दिला. 4. याव्यतिरिक्त, TRO लँडरेसमधील दोन लोकसंख्या आणि MCO लँडरेसमधील एक लोकसंख्या सध्याच्या अभ्यासात समाविष्ट केली गेली आणि संदर्भ म्हणून वापरली गेली. बारी विद्यापीठाच्या प्रायोगिक फार्म "पी मार्टुची" (41° 1'22.08″ N, 16°54'25.95″ E) मध्ये समान पर्यावरणीय परिस्थितीमध्ये सर्व वनस्पती सामग्रीची लागवड केली गेली होती, ज्यामुळे परस्पर परागण टाळण्यासाठी संरक्षण पिंजऱ्यात होते. लोकसंख्या आणि ब्लोफ्लाइजद्वारे इंट्रा-पॉप्युलेशन परागकण सुनिश्चित करणे (लुसिलिया सीझर). 16 लोकसंख्या बल्ब आकार आणि आकार आणि त्वचा आणि मांस रंग (टेबल S1) संबंधित वैशिष्ट्यांसाठी वैशिष्ट्यीकृत होती. याशिवाय, हाताने धरून ठेवलेल्या रीफ्रॅक्टोमीटरचा वापर करून घन विद्रव्य सामग्रीचे परीक्षण केले गेले आणि कांद्याच्या रसाच्या नमुन्यांमध्ये 2,4-डायनिट्रोफेनिल हायड्रॅझिन (0.125%) जोडून तिखटपणा मोजला गेला. v/v HCl च्या 2N मध्ये) आणि 420 nm वर शोषक मूल्यमापन करणे, द्वारे नोंदवल्याप्रमाणे [31]. महत्त्वपूर्ण फरकांची उपस्थिती निश्चित करण्यासाठी डंकनची बहु-श्रेणी चाचणी आणि SNK चाचणी घेण्यात आली.
टेबल 4 या अभ्यासात गोळा केलेल्या आणि जीनोटाइप केलेल्या लोकसंख्येची यादी. प्रत्येक लोकसंख्येसाठी, आयडेंटिफिकेशन कोड, स्थानिक नाव, जीपीएस कोऑर्डिनेट आणि बिया जतन करणारी जीन बँक नोंदवली जाते.
कोड | नाव | जीपीएस समन्वय | जीन बँक y |
ARO1 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’21.708″ N 16°49’1.631” E | Di.SSPA |
ARO2 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’14.28″ N 16°48’56.879” E | Di.SSPA |
ARO3 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’11.304″ N 16°49’13.079” E | Di.SSPA |
ARO4 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’3.348″ N 16°40’27.011” E | Di.SSPA |
ARO5 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°51’59.76″ N 16°53’0.527” E | Di.SSPA |
ARO6 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’48.72″ N 16°49’43.247” E | Di.SSPA |
ARO7 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’13.47″ N 16°50’23.783” E | Di.SSPA |
ARO8 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’18.816″ N 16°49’33.888” E | Di.SSPA |
ARO9 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54'५१.३७२″ N १६°49'3.504" E | Di.SSPA |
ARO10 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’1.188″ N 16°49’24.311” E | Di.SSPA |
ARO11 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52'५१.३७२″ N १६°49'48.575" E | Di.SSPA |
ARO12 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’38.892″ N 16°49’28.379” E | Di.SSPA |
ARO13 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’21.768″ N 16°49’29.711” E | Di.SSPA |
TRO1 | सिपोला रोसा लुंगा डी ट्रोपिया | - | Di.SSPA |
TRO2 | सिपोला रोसा टोंडा डी ट्रोपिया | - | Di.SSPA |
MCO | सिपोला रमाता डी मोंटोरो | - | Di.SSPA |
y Di.SSPA, मृदा, वनस्पती आणि अन्न विज्ञान विभाग, बारी विद्यापीठ. |
प्रति लोकसंख्येच्या 20 जीनोटाइपच्या पानांच्या सामग्रीचे नमुने घेण्यात आले आणि वापर होईपर्यंत -80 डिग्री सेल्सिअस तापमानात साठवले गेले. पॉलिसेकेराइड-समृद्ध प्रजातींसाठी, जसे A. cepa, पॉलिसेकेराइड काढून टाकण्याचे पहिले टप्पे चांगल्या-गुणवत्तेचे डीएनए मिळविण्यासाठी आवश्यक आहेत, म्हणून एसटीई बफरमध्ये (०.२५ एम सुक्रोज, ०.०३ एम ट्रिस, ०.०५ एम ईडीटीए) प्रारंभिक वॉश केले गेले. [52]. सीटीएबी पद्धतीनुसार एकूण डीएनए काढण्यात आला [53] आणि शेवटी नॅनो ड्रॉप 2000 UV-vis spectrophotometer (ThermoScientific, Waltham, MA, USA) आणि 0.8% agarose जेल इलेक्ट्रोफोरेसीस द्वारे गुणवत्ता आणि एकाग्रता तपासली गेली.
SSR विश्लेषण
द्वारे विकसित 16 EST-SSR प्राइमर संयोजन [54] आणि यापूर्वी अनुवांशिक विविधतेच्या अभ्यासात चाचणी केली गेली [43] आणि [44] आणि 21 जीनोमिक SSR [45-२२] त्यांच्या योग्यतेचे मूल्यांकन करण्यासाठी तपासणी केली गेली (पूरक तक्ता S4). आर्थिक फ्लोरोसेंट टॅगिंग पद्धतीचा वापर करून जीनोटाइपिंग केले गेले ज्यामध्ये प्रत्येक फॉरवर्ड एसएसआर प्राइमरमध्ये M13 शेपटी जोडली जाते. [56]. पीसीआर मिक्स 20 जीएल रिॲक्शनमध्ये तयार करण्यात आले होते ज्यात: एकूण डीएनएचे 50 एनजी, डीएनटीपी मिक्सचे 0.2 एमएम, पीसीआर रिॲक्शन बफरचे 1X, ड्रीमटॅक डीएनए पॉलिमरेझचे 0.8 यू (थर्मो सायंटिफिक, वॉल्थम, एमए, यूएसए), 0.16 ग्रॅम रिव्हर्स प्राइमर , M0.032 अनुक्रम (13′-TGTAAAACGACGGCCAGT-5′) सह विस्तारित फॉरवर्ड प्राइमरचे 3 gM, आणि FAM किंवा NED फ्लोरोसेंट रंगांसह (Sigma-Aldrich, St. Louis, US) लेबल केलेल्या युनिव्हर्सल M0.08 प्राइमरचे 13 gM. सिम्प्लीॲम्प (अप्लाईड बायोसिस्टम, सीए, यूएसए) थर्मोसायलरमध्ये बहुतेक प्राइमर जोड्यांसाठी खालील अटींसह पीसीआर प्रतिक्रिया केल्या गेल्या: 94 मिनिटांसाठी 5 °C, 40 s साठी 94 °C वर 30 चक्र, 58 °C 45 s आणि 72 °C 45 s साठी आणि 72 मिनिटांसाठी 5 ° C वर अंतिम वाढ. ACM446 आणि ACM449 साठी, 60 चक्रांवर 55 °C ते 10 °C पर्यंत ऍनिलिंगसह टचडाउन पीसीआर लागू केले गेले, 30 °C वर 55 चक्रे, त्यानंतर 5 °C वर 72 मिनिटांचा अंतिम विस्तार केला गेला. PCR उत्पादने 96-वेल प्लेटमध्ये लोड केली गेली आणि 14 gL Hi-Di Formamide (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) आणि 0.5 gL GeneScan 500 ROX Size Standard (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) मिसळली गेली. ABI PRISM 3100 Avant Genetic Analyzer (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) कॅपिलरी सिक्वेन्सिंग मशीनद्वारे ॲम्प्लिकॉन्सचे निराकरण केले गेले, जेथे एलील सह-प्रबळ म्हणून गुणांकित केले गेले आणि GeneMapper सॉफ्टवेअर आवृत्ती 3.7 वापरून नियुक्त केले गेले.
सॉफ्टवेअर्स GenAlEx 6.5 [57] आणि गर्भाशय ग्रीवा 3.0.7 [58] ॲलेल्सची संख्या (Na), प्रभावी ॲलेल्सची संख्या (Ne), निरीक्षण केलेले हेटरोजायगोसिटी (Ho), अपेक्षित हेटरोजायगोसिटी (He), बहुरूपी माहिती सामग्री (PIC), शॅननची माहिती निर्देशांक (I), आणि फिक्सेशन इंडेक्स (Fis ) प्रत्येक SSR लोकससाठी.
अनुवांशिक विविधतेचे मूल्यांकन
GenAlEx 6.5 द्वारे कांद्याच्या लोकसंख्येमध्ये आणि त्यातील अनुवांशिक भिन्नतेच्या श्रेणीबद्ध विभाजनाचे मूल्यांकन केले गेले. [57] आण्विक भिन्नता (AMOVA) च्या विश्लेषणाद्वारे 999 बूटस्ट्रॅपिंगसह महत्त्व तपासण्यासाठी. शिवाय, GenAlEx 6.5 सॉफ्टवेअरचा वापर सर्व SSR स्थानावरील Ho, He आणि Fis ची सरासरी मोजून प्रत्येक लोकसंख्येतील विविधतेचा अंदाज लावण्यासाठी केला गेला.
स्ट्रक्चर v.2.3.4 सॉफ्टवेअरमध्ये लागू केलेल्या बायेसियन मॉडेल-आधारित क्लस्टरिंग अल्गोरिदमद्वारे लोकसंख्येच्या संरचनेचा अंदाज लावला गेला. [59]. डेटा संच 1 ते 10 पर्यंतच्या अनेक काल्पनिक क्लस्टर्स (K) सह चालविला गेला, प्रत्येक K मूल्यासाठी दहा स्वतंत्र धावा सेट करा. प्रत्येक रनसाठी, परिणामांची सुसंगतता सत्यापित करण्याच्या उद्देशाने, 100,000 प्रारंभिक बर्न-इन कालावधी आणि 100,000 मार्कोव्ह चेन मॉन्टे कार्लो (MCMC) पुनरावृत्ती मिश्रण मॉडेल अंतर्गत आणि लोकसंख्येमध्ये स्वतंत्र ऍलील फ्रिक्वेन्सी अंतर्गत केली गेली. बहुधा K मूल्य AK पद्धतीची अंमलबजावणी करून निर्धारित केले गेले होते, ज्याचे वर्णन केले आहे [60], वेब-आधारित प्रोग्राम स्ट्रक्चर हार्वेस्टर मध्ये [61]. जेव्हा सदस्यत्व गुणांक (q-मूल्य) 0.7 पेक्षा जास्त असेल तेव्हा एखाद्या विशिष्ट क्लस्टरला वैयक्तिक लोकसंख्या नियुक्त केली गेली, अन्यथा ती मिश्रित वंशाप्रमाणे मानली गेली.
Nei च्या अनुवांशिक अंतर मॅट्रिक्स (पूरक सारणी S5) द्वारे प्रकट झालेल्या प्रवेशांमधील अनुवांशिक संबंधांचे नमुने दृश्यमान करण्यासाठी मुख्य समन्वय विश्लेषण केले गेले. एलील फ्रिक्वेन्सीच्या आधारे, POPTREEW सॉफ्टवेअरमध्ये अंकगणित सरासरी (UPGMA) क्लस्टर विश्लेषणासह वजन नसलेल्या जोडी गट पद्धतीची अंमलबजावणी करून अनुवांशिक अंतराचा एक डेंड्रोग्राम तयार करण्यात आला. [62]. डेटा सेटचे 100 रीसॅम्पलिंग सेट करून श्रेणीबद्ध क्लस्टरिंगमधील आत्मविश्वासाचे मूल्यांकन करण्यासाठी बूटस्ट्रॅपिंग लागू केले गेले. शेवटी, मेगा एक्स सॉफ्टवेअर [63] ट्री ड्रॉइंग सॉफ्टवेअर म्हणून वापरले होते.
पूरक साहित्य: येथे ऑनलाईन उपलब्ध आहेत http://www.mdpi.com/2223-7747/9/2/260/s1. तक्ता S1: ARO, MCO आणि TRO बल्बचे मॉर्फोलॉजिकल वैशिष्ट्य. तक्ता S2: एआरओ लँडरेसेस आणि टीआरओ आणि एमसीओ लँडरेससाठी गणना केलेले हेटरोजिगोसिटी आणि फिक्सेशन निर्देशांक. तक्ता S3: Fpt पॅरामीटरची जोडीनुसार मूल्ये. तक्ता S4: अभ्यासात वापरलेल्या SSR ची यादी. तक्ता S5. Nei अनुवांशिक अंतराचा जोडीनुसार लोकसंख्या मॅट्रिक्स. आकृती S1: इव्हानोच्या डेल्टा K सह बदलणारा K मूल्यांचा रेखा चार्ट.
लेखक योगदानः सीएल आणि एलआर यांनी अभ्यासाची कल्पना केली आणि प्रयोगाची रचना केली; CL आणि PI ने आण्विक मार्कर विश्लेषण केले; एआरएम आणि व्हीझेडने क्षेत्रीय चाचण्या केल्या; RM, SP, GR, आणि CL डेटा विश्लेषणामध्ये गुंतले होते; आरएम आणि सीएल यांनी हस्तलिखित लिहिले. सर्व लेखकांनी हस्तलिखिताच्या प्रकाशित आवृत्तीचे वाचन केले आहे आणि त्यास सहमती दिली आहे.
निधी: या कामाला प्रादेशिक अपुलियन प्रकल्प “अपुलियन भाजीपाल्याच्या प्रजातींची जैवविविधता”—प्रोग्रामा डी स्विलुप्पो रुराले प्रति ला पुगलिया २०१४-२०२० द्वारे निधी दिला गेला. मिसुरा 2014—सोट्टोमिसुरा 2020; CUP H10C10.2, इटली मंजूर करा.
प्रतिदाने: प्रयोगात वापरलेली वनस्पती सामग्री पुरवल्याबद्दल "Azienda Agricola Iannone Anna" आणि "Associazione produttori della vera cipolla rossa di Acquaviva" यांच्यामुळे पावती आहे.
स्वारस्याची विवाद: लेखक व्याजांचा कोणताही विरोध जाहीर करीत नाहीत.
संदर्भ
- 1. स्टर्न, WT Allium च्या किती प्रजाती ज्ञात आहेत? केव मॅग. 1992, 9, 180-182. [क्रॉस रफ]
- 2. फाओस्टॅट. FAO सांख्यिकी डेटाबेस. ऑनलाइन उपलब्ध: http://www.fao.org/2017 (8 जानेवारी 2019 रोजी ऍक्सेस केलेले).
- 3. ब्लॉक, ई. लसूण आणि कांद्याची रसायनशास्त्र. विज्ञान आहे. 1985, 252, 114-119. [क्रॉस रफ]
- 4. ली, बी.; जंग, जेएच; किम, HS उंदरातील अँटिऑक्सिडंट क्रियाकलापांवर लाल कांद्याचे मूल्यांकन. अन्न रसायन. टॉक्सिकॉल. 2012, 50, 3912-3919 [क्रॉस रफ]
- 5. ली, एसएम; चंद्र, जे.; चुंग, जेएच; चा, वायजे; शिन, एमजे क्वेर्सेटिन-युक्त कांद्याच्या सालीच्या अर्काचा उंदरांमध्ये धमनी थ्रोम्बोसिसवर प्रभाव. अन्न रसायन. टॉक्सिकॉल. 2013, 57, 99-105 [क्रॉस रफ] [पबएमड]
- 6. योशिनारी, ओ.; शिओजिमा, वाई.; इगाराशी, के. झुकर डायबेटिक फॅटी उंदीरांमध्ये कांद्याच्या अर्काचे लठ्ठपणाविरोधी प्रभाव. पोषक घटक 2012, 4,1518-1526 [क्रॉस रफ]
- 7. आकाश, एमएसएच; रेहमान, के.; चेन, एस. स्पाईस प्लांट Allium cepa: प्रकार 2 मधुमेह मेल्तिसच्या उपचारांसाठी आहारातील पूरक. पोषण 2014, 30, 1128-1137. [क्रॉस रफ] [पबएमड]
- 8. वांग, वाई.; टियान, डब्ल्यूएक्स; मा, एक्सएफ कांद्याचे प्रतिबंधक प्रभाव (ॲलियम सेपा एल.) फॅटी ऍसिड सिंथेस प्रतिबंधित करून कर्करोगाच्या पेशी आणि ऍडिपोसाइट्सच्या प्रसारावर अर्क. आशियाई पॅक. जे. कर्करोग पूर्व. 2012,13, 5573-5579 [क्रॉस रफ] [पबएमड]
- 9. लाइ, WW; हसू, अनुसूचित जाती; चुएह, एफएस; चेन, YY; यांग, जेएस; लिन, जेपी; ग्रहणाधिकार, जेसी; त्साई, सीएच; चुंग, JG Quercetin NF-kappaB आणि मॅट्रिक्स मेटालोप्रोटीनेज-2/-9 सिग्नलिंग मार्गांच्या प्रतिबंधाद्वारे SAS मानवी तोंडाच्या कर्करोगाच्या पेशींचे स्थलांतर आणि आक्रमण प्रतिबंधित करते. अँटीकॅन्सर Res. 2013, 33, 1941-1950. [पबएमड]
- 10. निकास्ट्रो, एचएल; रॉस, एसए; मिलनर, जेए लसूण आणि कांदे: त्यांचे कर्करोग प्रतिबंधक गुणधर्म. कर्करोग पूर्व. रा. 2015, 8,181-189 [क्रॉस रफ]
- 11. फोर्ट, एल.; टॉरिसेली, पी.; बोआनिनी, ई.; गॅझानो, एम.; रुबिनी, के.; फिनी, एम.; बिगी, ए. क्वेर्सेटिन-फंक्शनलाइज्ड हायड्रॉक्सीपाटाइटचे अँटीऑक्सिडंट आणि हाडांची दुरुस्ती गुणधर्म: इन विट्रो ऑस्टियोब्लास्ट-ऑस्टियोक्लास्ट-एंडोथेलियल सेल को-कल्चर स्टडी. Acta बायोमेटर. 2016, 32, 298-308 [क्रॉस रफ]
- 12. यामाझाकी, वाई.; इवासाकी, के.; मिकामी, एम.; यागीहाशी, ए. अकरा फ्लेवर प्रिकर्सर्सचे वितरण, S-Alk(en)yl-L-सिस्टीन डेरिव्हेटिव्ह्ज, सात एलियम भाज्यांमध्ये. अन्न विज्ञान. तंत्रज्ञान. रा. 2011, 17, 55-62 [क्रॉस रफ]
- 13. ब्लॉक, ई. वंशातील ऑरगॅनोसल्फर रसायनशास्त्र - सल्फरच्या सेंद्रिय रसायनशास्त्रासाठी परिणाम. अँजेव. केम. इंट. एड. इंग्लिश. 1992, 31, 1135-1178. [क्रॉस रफ]
- 14. ग्रिफिथ्स, जी.; ट्रुमन, एल.; क्रोदर, टी.; थॉमस, बी.; स्मिथ, बी. कांदे- आरोग्यासाठी जागतिक लाभ. फायटोथर. रा. 2002,16, 603-615 [क्रॉस रफ]
- 15. श्विमर, एस.; वेस्टन, डब्ल्यूजे तिखटपणाचे उपाय म्हणून कांद्यामध्ये पायरुव्हिक ऍसिडचा एन्झाईमॅटिक विकास. जे. अॅग्रिक. अन्न रसायन. 1961, 9, 301-304 [क्रॉस रफ]
- 16. केटर, कॅट; कांद्यामध्ये रँडल, डब्ल्यूएम तिखटपणाचे मूल्यांकन. मध्ये प्रयोगशाळा अध्यापनासाठी चाचणी केलेले अभ्यास; कार्चर, एसजे, एड.; असोसिएशन फॉर बायोलॉजी लॅबोरेटरी एज्युकेशन (सक्षम): न्यूयॉर्क, न्यूयॉर्क, यूएसए, 1998; खंड 19, पृ. 177-196.
- 17. हॅनेल्ट, पी वर्गीकरण, उत्क्रांती आणि इतिहास. मध्ये कांदे आणि संबंधित पिके, खंड. I. वनस्पतिशास्त्र, शरीरविज्ञान आणि आनुवंशिकी; Rabinowitch, HD, Brewster, JL, Eds.; CRC प्रेस: बोका रॅटन, FL, USA, 1990; पृ. 1-26.
- 18. रॅबिनोविच, एचडी; कुर्राह, एल. एलियम क्रॉप सायन्स: अलीकडील प्रगती; CABI प्रकाशन: वॉलिंगफोर्ड, यूके, 2002.
- 19. मल्लोर, सी.; कॅरावेडो, एम.; एस्टोपनन, जी.; मॅलर, एफ. कांद्याच्या अनुवांशिक संसाधनांचे वैशिष्ट्य (ॲलियम सेपा एल.) स्पॅनिश दुय्यम विविधता केंद्रातून. स्पॅन. जे. ॲग्रिक. रा. 2011, 9, 144-155. [क्रॉस रफ]
- 20. फेरियोली, एफ.; D'Antuono, इटली आणि युक्रेनमधील स्थानिक कांदा आणि शॉलॉट जर्मप्लाझममधील फिनोलिक्स आणि सिस्टीन सल्फॉक्साइड्सचे एलएफ मूल्यांकन. जेनेट. रिसूर. क्रॉप इव्होल. 2016, 63, 601-614 [क्रॉस रफ]
- 21. पेट्रोपोलोस, एसए; फर्नांडिस, ए.; बॅरोस, एल.; फरेरा, आयसीएफआर; Ntatsi, G. 'वाटिकिओटिको', ग्रीसमधील कांद्याच्या स्थानिक लँड्रेसचे आकृतिशास्त्रीय, पौष्टिक आणि रासायनिक वर्णन. अन्न रसायन. 2015,182, 156-163. [क्रॉस रफ]
- 22. लिगुओरी, एल.; आदिलेटा, जी.; नाझारो, एफ.; Fratianni, F.; डी मॅटेओ, एम.; अल्बेनीज, डी. बायोकेमिकल, अँटिऑक्सिडंट गुणधर्म आणि भूमध्यसागरीय क्षेत्रातील विविध कांद्याच्या जातींची प्रतिजैविक क्रिया. जे. खाद्य पदार्थ. चारित्र्य. 2019,13, 1232-1241. [क्रॉस रफ]
- 23. यू, केएस; पाईक, एल.; क्रॉसबी, के.; जोन्स, आर.; Leskovar, D. कांद्याच्या तिखटपणात फरक, वाण, वाढीचे वातावरण आणि बल्बच्या आकारामुळे. विज्ञान हॉर्टिक. 2006,110, 144-149. [क्रॉस रफ]
- 24. बीस्क, एन.; पेर्नर, एच.; श्वार्झ, डी.; जॉर्ज, ई.; क्रोह, एलडब्ल्यू; रोहन, एस. जीनोटाइपने प्रभावित कांद्याच्या बल्बच्या (ॲलियम सेपा एल.) विविध भागांमध्ये क्वेर्सेटिन-3, 4′-ओ-डिग्लुकोसाइड, क्वेर्सेटिन-4′-ओ-मोनोग्लुकोसाइड आणि क्वेर्सेटिनचे वितरण. अन्न रसायन. 2010,122, 566-571 [क्रॉस रफ]
- 25. कारुसो, जी.; कॉन्टी, एस.; विलारी, जी.; बोरेली, सी.; मेलचिओना, जी.; मिनुटोलो, एम.; रुसो, जी.; Amalfitano, C. कांद्याच्या उत्पादनावर, गुणवत्तेवर आणि अँटिऑक्सिडंट सामग्रीवर लावणीचा वेळ आणि वनस्पती घनतेचे परिणाम (ॲलियम सेपा एल.) दक्षिण इटलीमध्ये. विज्ञान हॉर्टिक. 2014,166, 111-120. [क्रॉस रफ]
- 26. पेरेझ-ग्रेगोरियो, एमआर; रेगुएरो, जे.; सिमल-गंडारा, जे.; रॉड्रिग्ज, एएस; अल्मेडा, डीपीएफ अँटिऑक्सिडंट फ्लेव्होनॉइड्सचा स्त्रोत म्हणून कांद्याचे अतिरिक्त मूल्य वाढवणे: एक गंभीर पुनरावलोकन. समीक्षक रेव्ह. फूड साइ. पोषक 2014, 54,1050-1062 [क्रॉस रफ] [पबएमड]
- 27. पोहन्ल, टी.; Schweiggert, RM; कारले, आर. कांद्यामध्ये विरघळणारे कर्बोदके आणि तिखट तत्त्वांवर लागवड पद्धती आणि लागवडीच्या निवडीचा प्रभाव (ॲलियम सेपा एल.). जे. अॅग्रिक. अन्न रसायन. 2018, 66, 12827-12835. [क्रॉस रफ] [पबएमड]
- 28. टेडेस्को, आय.; कार्बोन, व्ही.; स्पॅग्नुओलो, सी.; मिनासी, पी.; रुसो, GL दोन दक्षिण इटालियन जातींमधून फ्लेव्होनॉइड्सची ओळख आणि प्रमाणीकरण Iumलियम केपा एल., ट्रोपिया (लाल कांदा) आणि मोंटोरो (तांबे कांदा), आणि ऑक्सिडेटिव्ह तणावापासून मानवी एरिथ्रोसाइट्सचे संरक्षण करण्याची त्यांची क्षमता. जे. अॅग्रिक. अन्न रसायन. 2015, 63, 5229-5238 [क्रॉस रफ]
- 29. विलानो, सी.; एस्पोसिटो, एस.; Carucci, F.; फ्रुसियंट, एल.; कार्पुटो, डी.; Aversano, R. कांद्यामध्ये उच्च-थ्रूपुट जीनोटाइपिंग अनुवांशिक विविधतेची रचना आणि आण्विक प्रजननासाठी उपयुक्त माहितीपूर्ण SNPs प्रकट करते. मोल. जाती. 2019, 39, 5. [क्रॉस रफ]
- 30. मर्काटी, एफ.; लाँगो, सी.; पोमा, डी.; अरनिती, एफ.; लुपिनी, ए.; मामानो, एमएम; फिओर, एमसी; अबेनावोली, एमआर; सनसेरी, एफ इटालियन लाँग शेल्फ-लाइफ टोमॅटोचे अनुवांशिक भिन्नता (सोलॅनम लायकोपर्सिकम एल.) SSR आणि मॉर्फोलॉजिकल फळ वैशिष्ट्यांचा वापर करून संग्रह. जेनेट. रिसूर. क्रॉप इव्होल. 2014, 62, 721-732 [क्रॉस रफ]
- 31. गोन्झालेझ-पेरेझ, एस.; मल्लोर, सी.; गार्सेस-क्लेव्हर, ए.; मेरिनो, एफ.; ताबोडा, ए.; रिवेरा, ए.; पोमर, एफ.; पेरोविक, डी.; सिल्व्हर, सी. कांद्याच्या संग्रहातील अनुवांशिक विविधता आणि गुणवत्तेची वैशिष्ट्ये शोधणे (ॲलियम सेपा एल.) उत्तर-पश्चिम स्पेनमधील लँडरेस. जेनेटिक्स 2015, 47, 885-900 [क्रॉस रफ]
- 32. लोटी, सी.; Iovieno, P.; सेंटोमनी, आय.; Marcotrigiano, AR; फॅनेली, व्ही.; मिमिओला, जी.; सुमो, सी.; पवन, एस.; रिकियार्डी, एल. आनुवंशिक, जैव-कृषी, आणि काळेचे पौष्टिक वैशिष्ट्य (ब्रासिका ओलेरेसा एल. वर. acephala) अपुलिया, दक्षिण इटलीमधील विविधता. विविधता 2018,10, 25. [क्रॉस रफ]
- 33. बर्दारो, एन.; Marcotrigiano, AR; ब्राकुटो, व्ही.; मॅझेओ, आर.; Ricciardi, F.; लोटी, सी.; पवन, एस.; रिकियार्डी, एल. च्या प्रतिकाराचे अनुवांशिक विश्लेषण ओरोबांचे क्रेनाटा (काटा.) वाटाणा मध्ये (पिसम सॅटिव्हम एल.) लो-स्ट्रिगोलेक्टोन लाइन. जे. प्लांट पाथॉल. 2016, 98, 671-675
- 34. वाको, टी.; त्सुकाझाकी, एच.; यागुची, एस.; यामाशिता, के.; इटो, एस.; शिग्यो, एम. कांद्याचे घड काढण्याच्या वेळेसाठी परिमाणवाचक वैशिष्ट्य स्थानाचे मॅपिंग (ॲलियम फिस्टुलोसम एल.). युफिटिका 2016, 209, 537-546 [क्रॉस रफ]
- 35. ढाका, एन.; मुखोपाध्याय, ए.; परितोष, के.; गुप्ता, व्ही.; पेंटल, डी.; प्रधान, AK जेनिक SSR ची ओळख आणि SSR-आधारित लिंकेज नकाशाचे बांधकाम ब्रासिका जंसिया. युफिटिका 2017, 213, 15. [क्रॉस रफ]
- 36. आनंदन, एस.; मोटे, एसआर; गोपाल, जे. एसएसआर मार्कर वापरून कांद्याच्या जातीच्या ओळखीचे मूल्यांकन. बियाणे विज्ञान. तंत्रज्ञान. 2014, 42, 279-285 [क्रॉस रफ]
- 37. मित्रोवा, के.; स्वोबोडा, पी.; ओवेस्ना, जे. चेक प्रजासत्ताकमधील कांद्याच्या वाणांच्या भिन्नतेसाठी मार्कर सेटची निवड आणि प्रमाणीकरण. झेक जे. जेनेट. वनस्पती जाती. 2015, 51, 62-67 [क्रॉस रफ]
- 38. डी रिएनझो, व्ही.; मियाझी, एमएम; फॅनेली, व्ही.; साबेटा, डब्ल्यू.; मॉन्टेमुरो, सी. अपुलियन ऑलिव्ह जर्मप्लाझम जैवविविधतेचे संरक्षण आणि वैशिष्ट्य. Acta Hortic. 2018,1199,1-6 [क्रॉस रफ]
- 39. मल्लोर, सी.; अर्नेडो-अँड्रेस, ए.; गॅर्सेस-क्लेव्हर, ए. स्पॅनिशच्या अनुवांशिक विविधतेचे मूल्यांकन Iumलियम केपा मायक्रोसॅटलाइट मार्कर वापरून कांदा प्रजननासाठी लँडरेस. विज्ञान हॉर्टिक. 2014,170, 24-31. [क्रॉस रफ]
- 40. रिवेरा, ए.; मल्लोर, सी.; गार्सेस-क्लेव्हर, ए.; गार्सिया-उलोआ, ए.; पोमर, एफ.; सिल्व्हर, सी. कांद्यामधील अनुवांशिक विविधतेचे मूल्यांकन (Iumलियम केपा एल.) वायव्य स्पेनमधील लँडरेस आणि युरोपियन परिवर्तनशीलतेशी तुलना. NZJ क्रॉप हॉर्टिक. 2016, 44, 103-120. [क्रॉस रफ]
- 41. डी जियोव्हानी, सी.; पवन, एस.; टारंटो, एफ.; डी रिएनझो, व्ही.; मियाझी, एमएम; Marcotrigiano, AR; मंगिनी, जी.; मॉन्टेमुरो, सी.; रिकियार्डी, एल.; लोटी, सी. चण्याच्या जागतिक जर्मप्लाझम संग्रहाचे अनुवांशिक भिन्नता (Cicer arietinum एल.) अनुवांशिक इरोशनच्या धोक्यात असलेल्या इटालियन ऍक्सेसन्ससह. फिजिओल. मोल. बायोल. वनस्पती 2017, 23, 197-205. [क्रॉस रफ]
- 42. मॅझेओ, आर.; Morgese, A.; सोननटे, जी.; झुलुआगा, डीएल; पवन, एस.; रिकियार्डी, एल.; लोटी, सी. ब्रोकोली राबेमध्ये अनुवांशिक विविधता (ब्रासिका रापा L. subsp. सिल्वेस्ट्रिस (L.) Janch.) दक्षिण इटलीहून. विज्ञान हॉर्टिक. 2019, 253, 140-146. [क्रॉस रफ]
- 43. जक्से, एम.; मार्टिन, डब्ल्यू.; मॅकॉलम, जे.; हॅवे, एम. सिंगल न्यूक्लियोटाइड पॉलिमॉर्फिझम, इंडल्स आणि कांदा लागवडीच्या ओळखीसाठी साध्या क्रमाची पुनरावृत्ती. जे. ए.एम. समाज हॉर्टिक. विज्ञान 2005,130, 912-917 [क्रॉस रफ]
- 44. मॅकॉलम, जे.; थॉमसन, एस.; पिथर-जॉयस, एम.; केनेल, एफ. अनुवांशिक विविधता विश्लेषण आणि एकल-न्यूक्लियोटाइड पॉलिमॉर्फिझम मार्कर विकसित बल्ब कांद्यामध्ये व्यक्त अनुक्रम टॅग-सिंपल सिक्वेन्स रिपीट मार्करवर आधारित. जे. ए.एम. समाज हॉर्टिक. विज्ञान 2008,133, 810-818 [क्रॉस रफ]
- 45. बाल्डविन, एस.; पिथर-जॉयस, एम.; राइट, के.; चेन, एल.; मॅकॅलम, जे. बल्ब कांद्याच्या आतील आणि त्यांच्यामध्ये अनुवांशिक विविधतेच्या अंदाजासाठी मजबूत जीनोमिक साध्या अनुक्रम पुनरावृत्ती मार्करचा विकास (ॲलियम सेपा एल.) लोकसंख्या. मोल. जाती. 2012, 30, 1401-1411. [क्रॉस रफ]
- 46. डेवूडी, जेए; हनीकट, आरएल; पांढऱ्या शेपटी हरणात स्कॉ, एलसी मायक्रोसेटेलाइट मार्कर. जे. हेरेड. 1995, 86, 317-319 [क्रॉस रफ] [पबएमड]
- 47. खोडादादी, एम.; हसनपनाह, डी. इराणी कांदा (ॲलियम सेपा एल.) प्रजनन उदासीनतेला प्रतिसाद देते. जागतिक ऍपल. विज्ञान जे. 2010,11, 426-428
- 48. अब्दु, आर.; बकासो, वाई.; Saadou, M.; बॉडोइन, जेपी; हार्डी, ओजे नायजर कांद्याची अनुवांशिक विविधता (ॲलियम सेपा एल.) साध्या क्रम पुनरावृत्ती मार्कर (SSR) द्वारे मूल्यांकन. Acta Hortic. 2016,1143, 77-90 [क्रॉस रफ]
- 49. पवन, एस.; लोटी, सी.; Marcotrigiano, AR; मॅझेओ, आर.; बर्दारो, एन.; ब्राकुटो, व्ही.; रिकियार्डी, एफ.; टारंटो, एफ.; डी'अगोस्टिनो, एन.; शियावुल्ली, ए.; इत्यादी. जीनोम-व्यापी मार्कर शोध आणि जीनोटाइपिंगद्वारे प्रकट केल्याप्रमाणे लागवड केलेल्या चणामधील एक वेगळे अनुवांशिक क्लस्टर. वनस्पती जीनोम 2017, 2017,10. [क्रॉस रफ]
- 50. पवन, एस.; Marcotrigiano, AR; सिआनी, ई.; मॅझेओ, आर.; झोंनो, व्ही.; रुग्गेरी, व्ही.; लोटी, सी.; रिकियार्डी, एल. खरबूजाचे जीनोटाइपिंग-बाय-सिक्वेंसिंग (कुकमिस मेलो एल.) विविधतेच्या दुय्यम केंद्रातून जर्मप्लाझम संकलन अनुवांशिक भिन्नतेचे नमुने आणि भिन्न जनुक पूलांच्या जीनोमिक वैशिष्ट्यांवर प्रकाश टाकते. बीएमसी जीनोम. 2017, 18, 59. [क्रॉस रफ]
- 51. डी रिएनझो, व्ही.; सायन, एस.; टारंटो, एफ.; डी'अगोस्टिनो, एन.; मॉन्टेमुरो, सी.; फॅनेली, व्ही.; साबेटा, डब्ल्यू.; बोचेफा, एस.; तामेंदजरी, ए.; पासक्वॉलोन, ए.; इत्यादी. भूमध्यसागरीय खोऱ्यातील ऑलिव्ह लोकसंख्येमध्ये अनुवांशिक प्रवाह. पीर जे. 2018, 6. [क्रॉस रफ]
- 52. शेफर्ड, एलडी; मॅकले, टीजी पॉलिसेकेराइड-समृद्ध वनस्पती ऊतकांपासून डीएनए वेगळे करण्यासाठी दोन मायक्रो-स्केल प्रोटोकॉल. J. वनस्पती रा. 2011,124, 311-314 [क्रॉस रफ]
- 53. डॉयल, जेजे; डॉयल, जेएल ताज्या ऊतीपासून वनस्पती डीएनएचे अलगाव. फोकस 1990,12, 13-14.
- 54. कुहल, जेसी; चेउंग, एफ.; कियाओपिंग, वाई.; मार्टिन, डब्ल्यू.; Zewdie, Y.; मॅकॉलम, जे.; Catanach, A.; रदरफोर्ड, पी.; सिंक, केसी; जेंडरेक, एम.; इत्यादी. 11,008 कांदा व्यक्त केलेल्या अनुक्रम टॅगचा एक अनोखा संच मोनोकोट ऑर्डर ॲस्पॅरगेल्स आणि पोलमधील व्यक्त अनुक्रम आणि जीनोमिक फरक प्रकट करतो. वनस्पती सेल 2004,16, 114-125 [क्रॉस रफ]
- 55. किम, एचजे; ली, एचआर; ह्यून, जेवाय; गाणे, केएच; किम, केएच; किम, जेई; हुर, सीजी; एसएसआर फाइंडर वापरून कांद्याच्या अनुवांशिक शुद्धता चाचणीसाठी हार्न, सीएच मार्करचा विकास. कोरियन जे. जाती. विज्ञान 2012, 44, 421-432 [क्रॉस रफ]
- 56. शुल्के, एम. पीसीआर तुकड्यांच्या फ्लोरोसेंट लेबलिंगसाठी एक आर्थिक पद्धत. नॅट. बायोटेक्नॉल. 2000, 18, 233-234 [क्रॉस रफ] [पबएमड]
- 57. पीकॉल, आर.; Smouse, PE GenAlEx 6.5: Excel मध्ये अनुवांशिक विश्लेषण. शिक्षण आणि संशोधनासाठी लोकसंख्या अनुवांशिक सॉफ्टवेअर: एक अद्यतन. बायोइन्फॉर्मेटिक्स 2012, 28, 2537-2539 [क्रॉस रफ] [पबएमड]
- 58. कालिनोव्स्की, एसटी; टेपर, एमएल; मार्शल, टीसी संगणक प्रोग्राम CERVUS जीनोटाइपिंग त्रुटी कशी सामावून घेतो याचे पुनरावलोकन केल्याने पितृत्व असाइनमेंटमध्ये यश वाढते. मोल. इकोल. 2007,16, 1099-1106. [क्रॉस रफ]
- 59. प्रिचर्ड, जेके; स्टीफन्स, एम.; रोसेनबर्ग, एनए; डोनेली, पी. असोसिएशन संरचित लोकसंख्येमध्ये मॅपिंग. आहे. जे. हम. जेनेट. 2000, 67, 170-181 [क्रॉस रफ]
- 60. इव्हानो, जी.; रेग्नॉट, एस.; गौडेट, जे. सॉफ्टवेअर वापरून व्यक्तींच्या क्लस्टर्सची संख्या शोधणे संरचना: एक सिम्युलेशन अभ्यास. मोल. इकोल. 2005,14, 2611-2620 [क्रॉस रफ]
- 61. अर्ल, डी.; वॉनहोल्ड, बी. स्ट्रक्चर हार्वेस्टर: स्ट्रक्चर आउटपुटचे व्हिज्युअलायझेशन आणि इव्हानो पद्धत लागू करण्यासाठी वेबसाइट आणि प्रोग्राम. संवर्धन करा. जेनेट. रिसूर. 2011, 4. [क्रॉस रफ]
- 62. टेकझाकी, एन.; नेई, एम.; Tamura, K. POPTREEW: एलील फ्रिक्वेन्सी डेटावरून लोकसंख्येची झाडे तयार करण्यासाठी आणि इतर काही प्रमाणांची गणना करण्यासाठी POPTREE ची वेब आवृत्ती. मोल. बायोल. उत्क्रांत. 2014, 31, 1622-1624 [क्रॉस रफ]
- 63. कुमार, एस.; स्टेचर, जी.; ली, एम.; Knyaz, C.; तमुरा, के. मेगा एक्स. संगणकीय प्लॅटफॉर्मवर आण्विक उत्क्रांती अनुवांशिक विश्लेषण. मोल. बायोल. उत्क्रांत. 2018, 35, 1547-1549. [क्रॉस रफ]